Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IGSF9Q9P2J2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms