Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHPF2Q9P2E5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms