Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ABCC13Q9NSE7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms