Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB6BQ9NRW1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms