Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP58Q9BVL2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms