Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SGIP1Q9BQI5 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms