Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHOX2BQ99453 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms