Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CHMP1B-201ENST00000526991 3054 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PCSK1-202ENST00000508626 2234 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ATP8B2-202ENST00000368489 5861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CARMN-205ENST00000518014 5131 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 POLR3F-201ENST00000377603 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PRAC1Q96KF2 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms