Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT28Q7Z3Y7 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT28Q7Z3Y7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms