Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTF1AQ7RTS3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTF1AQ7RTS3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms