Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms