Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms