Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms