Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP21-3Q3LHN1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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