Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
USP41Q3LFD5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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