Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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