Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMD2Q13200 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms