Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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FOXI1Q12951 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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FOXI1Q12951 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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FOXI1Q12951 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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FOXI1Q12951 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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FOXI1Q12951 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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FOXI1Q12951 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FOXI1Q12951 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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