Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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