Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC173Q0VFZ6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms