Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms