Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAD51Q06609 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2027.3 ms