Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE3AQ05086 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms