Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN1Q04323 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms