Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms