Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
UBE2E1P51965 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
UBE2E1P51965 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms