Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB28P51157 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms