Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms