Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms