Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA4P35212 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA4P35212 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA4P35212 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA4P35212 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA4P35212 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GJA4P35212 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms