Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA7P31268 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms