Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCAP28676 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCAP28676 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCAP28676 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms