Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFP26441 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFP26441 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFP26441 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms