Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCP25054 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCP25054 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
APCP25054 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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