Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms