Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXB9P17482 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXB9P17482 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXB9P17482 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms