Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms