Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APODP05090 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APODP05090 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APODP05090 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APODP05090 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APODP05090 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APODP05090 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APODP05090 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APODP05090 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APODP05090 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APODP05090 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
APODP05090 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APODP05090 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APODP05090 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APODP05090 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APODP05090 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APODP05090 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms