Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NSD2O96028 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NSD2O96028 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSD2O96028 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSD2O96028 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NSD2O96028 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NSD2O96028 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NSD2O96028 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSD2O96028 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NSD2O96028 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSD2O96028 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NSD2O96028 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms