Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E2F6O75461 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F6O75461 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 350.4 ms