Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMAD6O43541 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMAD6O43541 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms