Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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