Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF208O43345 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms