Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms