Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
E9PCH4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
E9PCH4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E9PCH4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E9PCH4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E9PCH4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E9PCH4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E9PCH4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
E9PCH4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E9PCH4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
E9PCH4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E9PCH4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PCH4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PCH4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PCH4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E9PCH4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms