Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRDCB7Z8K6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms