Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AGAP5A6NIR3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms