Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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