Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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