Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIN28AQ9H9Z2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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